• структура современной экономической теории
• "революции" в истории экономической науки
• история и методология экономической науки
• модель человека в экономической теории
• перевод и издание трудов классиков экономической науки

• История экономических учений
• Модель человека в экономической науке
• История и философия науки

Книги

• Автономов В.С. Человек в зеркале экономической теории. Очерки истории экономической мысли. М.: Наука, 1993.
• Автономов В.С. Модель человека в экономической  науке. СПб.: Экономическая  школа, 1998.
• Автономов В.С. и др. Очерки экономической антропологии / В.С. Автономов, А.Г. Гаджиев, Е.Н. Калмычкава, Д.Н. Платонов. М.: Наука, 1999.
• Автономов В.С. Русская литература на рандеву с рыночной экономикой. М.: ТЕИС, 2000.
• Автономов В.С. История экономических учений.  М.: ИНФРЛ-М, 2000 (в соавторстве).

Статьи 

• Автономов В.С. Модель человека в экономической теории и других социальных науках // Истоки. Вып. 3 / Редкол.: Я.И. Кузьминов (гл. ред.), В.С. Автономов, О.И. Ананьин и др.; вступ. статья Я.И. Кузьминова. М.: ГУ-ВШЭ, 1998. С. 24–71.
• Автономов В.С. Поиск новых решений (модель человека в западной экономической теории 1900 –1920-х годов) // Истоки. Вып. 2: Вопросы истории народного хозяйства и экономической мысли / Под ред. В.А. Жамина, А.А. Баранова, Я.И. Кузьминова. М.: Экономика, 1990. С. 187–200.
• Автономов В.С. Не дорого ценю я громкие права ("тайные свободы“ или гражданское общество) // Истоки. Вып. 4. М.: ГУ-ВШЭ, 2000.
• Автономов В.С. История экономической мысли и экономического анализа: место России // Вопросы экономики. 2001.  № 2. С. 42–48.